反洗钱会计的程序主要包括识别、调查、记录和报告这四步。
在识别环节，银行、海关等机构将发现的大额可疑资金的提取、划转等情况报送给反洗钱信息情报中心，反洗钱会计对这些情况进行分析和判断，对存在的可疑交易和情况进行识别。
在调查环节，反洗钱会计对初步识别的可疑情况进行专门的调查，对可疑资金的关系人进行追查，根据已经掌握的情况顺藤摸瓜，弄清犯罪分子的洗钱事实。
记录是将掌握的各种犯罪分子洗钱的各种证据通过一定的方式记录下来，并整理分类。
在报告环节，犯罪分子洗钱的基本事实已经查清，证据收集工作已经完毕。反洗钱会计利用会计专门方法对前几个环节的过程进行汇总，撰写会计报告，向相关各部门提供反洗钱会计报告。