・452・ Journal ofClinical andExperimentalMedicine Vo1.14。No.6 Mar.2015 2010,363(8):733—742. 研究[J].实用肿瘤学杂志,2006,20(1):56—57. [7]Van der Burg ME,Vergote I,Onstenk W,et 1.Long—taerm results of [13]王兴春.老年非小细胞肺癌患者化疗后细胞免疫功能的变化[J]. weekly paclitaxel carboplatin induction therapy:an effective and well— 中国老年学杂志,2014,16(7):1796—1797. [14]钟连花.八珍颗粒配合食管癌术后放化疗的临床疗效观察[c].福 [J].Eur J Cancer,2013,49(11):1254—1263. 州:福建中医药大学,2010. [8] 郎济禄,孙贤.养正合剂联合化疗治疗晚期非小细胞肺癌的临床 [15]孙卓.八珍颗粒联合化疗治疗晚期乳腺癌30例临床观察[J].中国 效果观察[J].实用肿瘤学杂志,2012,26(3):259—261. 当代医药,2009,16(11):121—122. [9]Shoni M,Parra—Herran CE,May T,et 1a.Mulitple synchronous pri・ [16]黄海红.八珍颗粒治疗贫血5O例[J].中国社区医师(医学专业), mary gynecol0gic malignancies in all MSH2 mutation carrier with endo- tolerated teatrment in patients with platinum—resistant ovarian cancer metriosis[J].J Clin Oncol,2013,31(3):e33—36 [1O]雒志明,畅怡,聂秀红.紫杉醇联合卡铂治疗老年非小细胞肺癌毒 性反应及对策的临床分析(附155例报告)[J].北京医学,2007, 29(9):537—539. 2010,12(31):135. 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(收稿日期:2014—10—15) DOI:10.3969/j.issn.1671-4695.2015.06.007 文章编号:1671—4695(2015)06—0452—03 MassARRAY Assay高通量技术 检测胃癌LTA单核苷酸多态性及其临床应用 李如凯 郭龙华 (1深圳市宝安区石岩人民医院检验科2深圳市龙华新区人民医院检验科【摘要】 目的广东 深圳518108; 广东 深圳518109) 探讨LTA基因单核苷酸多态性与胃癌易感性的相关性。方法 选择60例胃癌患者和6O例健康 人群为研究对象。采用MassARRAY Assay高通量技术检测淋巴毒素一ot(LTA)基因单核苷酸(SNP)位点rs909253基因 多态性,分析其出现频率及与胃癌易感性的相关性。结果 胃癌组与正常组在AA基因频率(20.00%vs.21.67%)差异 无统计学意义;G等位基因、GA、GG+GA基因型或变异基因型与胃癌易感风险相关[OR(95%CI):1.48(1.15—1.99)、 1.36(1.05~1.68、1.32(1.22—1.65)]。结论【关键词】 胃癌LTA基因rs909253位点单核苷酸多态性与胃癌易感性相关,G等位基 因、GG、GA、GG+GA基因型或变异基因型可能是胃癌发病的危险因素。 MassARRAY Assay LTA单核苷酸多态性 Ma ̄ARRAY Assay high—throughput technique to detect gastric cancer LTA t ̄tgle nucleotide polymorphtsms.L/Ru—kai ,GUO 一hua .1 DepartentomfLaboratory,Bao"anDistrict ShiyanPeople'sHospital,Shenzhen Guangdong 518108,China;2DepartentomfLaboratory, Longhua District People's Hospital,Shenzhen Guangdong 518109,China. 【Abstract】 Objective To study correlation between LTA single nucleotide polymorphisms(SNP)and susceptibility of gastric cancer. Methods lymphotoxin— (LTA),SNP loci rs909253 gene polynmrphism was detected by Mass array Assay hiSh—throughput in 60 cases pa- tients with gastric cancer and 60 cases wih thealthy people.The correlation between frequency and suseeptibility of gastric cancer was naalyzed.Re- suits there was no statistically signiifcant diference of AA gene fequency(2O.0o%vs.21.67%)betrween gastric cancer group and normal group.G allele,GA,GG type+GA genotype OR genetic varintas associated with the risk of susceptibility of gastirc cancer[0R(95%ci):1.48 (1.15—1.99),1.36(1.05~1.68),1.32(1.22~1.65)].Condusion Single nueleotide polymorphisms of LTA rs909253 and susceptibility of gastic cancerr are possibly related.G allele,GG,GA,GG+GA genotype or mutation genotype may be a risk factor of gastric cancer. 【Key wordsl Gastric cancer;Mass ARRAY Assay;LTA;Single nucleotide polymorphisms 胃癌是临床常见的恶性肿瘤之一,占消化道恶性肿 性(SNP)是常见的单碱基突变,为新一代遗传学标记突 瘤的第一位,发病机制尚未完全,可能与幽门螺杆菌感 变方式 J,常见的研究方法有变性梯度凝胶电泳酶切 染、遗传、环境等因素有关。早期症状并不明显,很大程 法、构象多态性、TagMan探针法、限制性片段长度多态 度影响了治疗效果。因此寻找特异性标志物,对于胃癌 性等,但均存在通量低、检测成本高、无法实现自动化等 2 3。MassARRAY采用质谱检测技术进行核酸分 的早期诊断与筛查有极其重要的意义。单核苷酸多态 缺陷[析,融汇了PCR技术的高灵敏性以及质谱技术的高精 2012年深圳市科技局课题:利用MassARRAY Assay高通量技术检测 确性,具有位点选择灵活、检测结果可靠、检测通量高、 胃癌相关基因单核苷酸多态性及其临床应用(编号:201203295) 临床和实验I玉学毒志2015年3月 第14卷 第6期 ・453・ 检测成本低的优点。本研究采用MassARRAY Assay高 >0.05);胃癌组与正常组GA、GG+GA表达频率差异均 通量技术,检测LTA基因rs929253多态性与胃癌易感 有显著性(P<0.5,P<O.001)。采用多因素回归分析, 对年龄、性别、吸烟史、饮酒史、肿瘤家族史校正后,GA、 性的关系。 GG+GA基因型或变异基因型OR(95%ci)分别为1.48 1对象与方法 1.1研究对象选择2012年3月至2013年3月我院 (1.15~1.99)、1.36(1.05~1.68);G等位基因与A等位 收治的胃癌患者60例为胃癌组,均经病理确诊。选择 基因比较,0R(95%CI)为1.32(1.22~1.65)。见表2。同期60例健康人群为正常组,按照性别与年龄与胃癌 组进行匹配。本次研究方案报经医院伦理委员会批准, 所有受检对象均签署知情同意书。两组纳入对象的性 别构成比、年龄比较差异无显著性(P>0.05);吸烟 表2 LTArs909253等位基因与基因型分布[例(%)] 基因型 胃癌组(n=60)正常组(n=60)× 值0R(95% ̄I)P值 史、饮酒史、肿瘤家庭史等资料经检验比较差异有统计 学意义(P<0.05)。见表1。 表1两组患者临床资料对比 资料 胃癌组(n=60)正常组(n=60)t/)(2值P值 1.2方法 I.2.1 DNA提取空腹条件下取外周血标本2 ml,置 于70℃保存。采用美国OMEGA公司DNA提取试剂盒 提取DNA,严格按照试剂盒操作说明书进行,紫外核酸 定量,提取DNA稀释至5 ng/}xl保存于一70%备用。 1.2.2 引物设计采用Assay Desiger设计软件,对 LTA+252位点(rs909253)单核苷酸多态性(SNP)位点 设计引物和PCR扩增,PCR引物:5 一ACGTFGGAT. GAGACAGAGAGAGAGAGGAAG一3,、5 一ACGTYGGAT— GACTCTCCATCTCTCAGTCTC一3,;延伸引物:5 一GAAG— GAACAGAGAGGAA——3"0 1.2.3基因分型采用Mass ARRAY分子阵列分析系 统,对LTA基因(rs909253)位点作基因分型。①PcR反 应:94oC 5 min;94℃20 s,56oC 30 8,72oc 1 rain;72℃1 min,42个循环;72cI=3 min。②虾碱性磷酸酶(SAP)反 应:37 ̄C1 min,85 ̄C 10 min,完成后降至4℃保存。③单 碱基延伸反应:94℃15 min;94oC 20 8,56℃30 s,72oC 1 arin,72 ̄C 3 min,完成后4℃保存。④检测分型:采用 Mass ARRAY运行程序点样检测,根据等位基因分子质 量差异进行分型。 1.3观察指标观察胃癌组与正常组、胃癌组与正常 组不同性别、年龄在G、A等位基因、GG、GA、AA、GG+ GA出现频率。 1.4统计学分析 所有计数资料均用频数(I'1)或率 (%)表示,经Hardy—Weinberg平衡检验,采用SPSS 14.0软件进行卡方检验,多因素分析采用Logistic回 归。检验标准:P<0.05。 2结果 2.1 LTArs909253位点基因多态性与胃癌易感性分析 胃癌组与正常组在AA基因频率差异无统计学意义(P 注:“一”为一个相对比较值。 2.2不同性别LTArs909253位点基因多态性与胃癌易 感性分析男性与女性胃癌组与正常组基因类型比较 差异均无显著性(P>0.05)。见表3。 表3不同性别中LTArs909253基因类型与胃癌易感性的关系【例(%)] 2.3不同年龄LTArs909253位点基因多态性与胃癌易 感性分析以50岁作为一个临界点,>150岁与<50岁 胃癌组与正常组基因类型频率比较差异无显著性(P> 0.05)。见表4。 表4不同年龄LTArs909253基因类型与胃癌易感性的关系 [例(%)] 3讨论 胃癌是胃肠黏膜发生的恶性肿瘤,是我国最常见的 消化道路恶性肿瘤,患病率和病死率居各种类消化道恶 性肿瘤的首位L3 J。MassARRAY分子量阵列技术是Seg— uenom公司推出的最先进的基因分析工具,通过将简 单、可靠的引物延伸反应与MALDI—TOF—MS技术结 合,达到基因分型检测的目的,具有高通量、高灵敏度、 高准确度的优势 J。 LTA基因位于HLA—B与HLA—C之间,也称淋巴 毒素 ,因体内淋巴细胞受到有丝分裂原或抗原刺激活 化后而分泌的一种细胞炎性因子 J,属于肿瘤坏死因子 家族成员,其第一内含因子+252位点rs909253多态性 直接影响到LTA基因的转录水平 J。国内外研究结果 表明,LAT+252等位基因(A—G)突变可能影响到血浆 ・454。 Journal ofClinical andExperimentalMedicine Vo1.14,No.6 Mar.2015 中或体外TNF—p的表达,进而诱发肿瘤坏死因子 感性相关,G等位基因、GG、GA、GG+GA基因型或变异 ( rNF—ot)、干扰素(IFN一^y)、白细胞介素1(IL一1)、白 基因型可能是胃癌发病的危险因素。 细胞介素6(IE一6)、白细胞介素8(IL一8)等致炎性细 参考文献 胞因子的产生,促进胃癌的发生与发展[ 。Gen等 有 [1]关去哲.JWA基因+723G/T基因型单核苷酸多卷f生对表浅性膀胱癌患 关13本人群的研究表明,LTA+252位点处G等位基因 者预后的影响[J].中国实验诊断学,2012,16(9):1710—1712. [2]Ding GG,Zhang GL,Chetr XC,ct a1.A study on the relationship be— tween single nueleotide polymorphisms of intedeukin一22 and suscepti— 以及GG基因型人群发生胃癌的几率风险远高于其它 位点和其它基因类型,而Deans等 在有关英国人群的 研究中报道,m+252位点基因G/A多态性与发生胃 癌风险关联性不大,提示对于不同的人群LTA+252单 核苷酸多态性与胃部发生相关性不尽相同。 bility to pulmonary tuberculosis[J].ZhonghHa Jie He He Xi Za Zhi, 2012,35(8):596—600. [3]刘金龙,邬淑雁,刘丽红,等.外周血生存素的表达与胃癌生物学 行为相关性研究[J].中国实验诊断学,2012,16(1):57—59. [4] Saieg MA,Geddie WR,Boemer SL,et a1.EZH2 and CD79B mutation— al status overtimeinB——cell non—-Hodgkinlymphomas detected by high 本研究以我院收治的60例胃癌患者和健康患者为 研究对象,通过分析LTA+252位点基因分布频率,在等 位基因G、A比较上,表现出明显的相关性OR(95%CI) throughput sequencing using minimal samples[J].Cancer Cytopathol, 2013,121(70):377—386. —[5] Gareia—Gonzalez MA,Ncolas—Perez D,Lanas A,et a1.Prognostic role of host cyclooxygenase and cytokine genotypes in a Caucasian coho ̄ 为1.34(1.0l一1.73),与何选秋等 的研究结果基本 致。在基因类型AA分布频率上,胃癌组与正常组在 AA基因频率(20.00%vs.21.67%)差异无统计学意义, 一of patients with gastirc adenocarcinoma[J].PLoS One,2012,7(9): e46179. [6]Suzuki G,Cullings H,Fujiwara S,et a1.m 252GG and GA Genotypes aIe Associated with Difuse—Type Noncardia Gastric CItno ̄r斑sk in the 提示AA基因类型与胃癌易感性没有相关性。与傅冷 西等 关于TNF—B+252 A等位基因和IL一10启动 子一1082A等位基因可能是胃癌发生的易感基因的研 究报道不一致,可能与研究对象的选择、检测方法有关。 进一步研究发现,在校正年龄、吸烟史、饮酒史、肿瘤家 族史等因素后,GG、GA、GG+GA基因类型与胃癌诱发 风险呈正相关性,与国内外文献报道基本一致¨ 。 本研究结果还发现,尽管胃癌的易感性与G等位基 Japanese Population[J].Helicobacter,2009,149(6):571—579. [7]Lu R,Dou x,Zhang J,et a1.A functionla polymorphism oflymphotox・ in—alpha(L IIA)gcne m909253 is associated with gastric cancer risk in an Asian popue380—61ation[J].Cancer Epidemiol,2012,36(6):e380 一e386. [8]Suzuki G,Cullings H,Fujiwara S,et a1.加1A 252GG and GA Geno- types are Assciatoed wih Ditffuse—Type Noncardia Gasticr Cancer Risk in the Japanese Population[J].Helicobacter,2009,14(6):571-579. [9]Deans DA,Tan BH,Ross JA,et a1.Cancer cachexia is ssaociated with he ILl0—t-1082 gene promoter polymorphism in patients with gas ̄oe-- 因、GG、GA、GG+GA等基因类型有关,但与受检人群的 年龄、性别没有相关性。这一研究结果有助于我们调整 胃癌早期诊断思路,同时,由于胃癌易感性与 LTArs909253位点单核苷酸多态性作用机制不十分明确, 加上本文采用的是病例对照研究,且样本数量较小,所得 结果需要进一步的大样本的前瞻性研究来予以证实。 4结论 sphageael malignancy[J].Am J Clin Nutr,2009,89(4):1164—1172. [10]何选秋,李粉霞,杨学习.LTA基因单核苷酸多态位点与胃癌易感 性的研究[J].分子诊断与治疗杂志,2011,3(4):241—244. [11]傅冷西,彭孝纬,何利平,等.CIM T细胞及其相关前炎症细胞因 子基因多态性与胃癌发生的关系[J].中国综合临床,2008,24(3): 2O4—2o7. 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