国家一二三级保护植物名录有国家一级保护野生植物有金茶花、银杉、水杉、珙桐、桫椤、秃杉、望天树、青皮树、台湾杉等；国家二级保护野生植物有伯乐树、资源冷杉、矮沙冬青、琼棕、光叶蕨、杜仲等；国家三级保护野生植物有桂滇桐、肉苁蓉、黄连、台湾苏铁、天麻、梭梭等。
受国家重点保护的野生植物一共约有1700种，一级保护有67种和4类，二级保护的352种和9类，其中还包含了蓝藻1种、真菌3种，蕨类植物14种和4类，裸子植物40种和4类，被子植物361种和5类。
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