一般来讲，民政局协议离婚优点是比较方便，只要双方达成一致意见，提供有关证件和资料以及照片等即可随时领取离婚证。而在法院达成调解协议则程序较繁琐，需先立案后再调解，我国目前大部分地区人民法院已经把此类案件列为速裁庭，一周即可处理结案。如适用简易程序案件，办理所需时间相对较长。一般是十五天至三十天，时间最快的也有当天办理的。
二、当事人双方离婚的费用不同
一般情况民政局协议离婚经济，一般是人民币二十元，而人民法院调解离婚，无夫妻共同财产分割的，当然各个地区人民法院费用不一样，一般是人民币260元外加其他费用；涉及财产分割的，20万元以下的不再收费用，超过部分，需按照财产标的收费。因此，如果夫妻共同财产有价值几十万元的房产，所缴的诉讼费也相对较高。
三、当事人双方离婚的证件资料要求不同
民政局协议离婚只要双方达成一致意见，写一个离婚协议、提供结婚证、身份证、户口簿和照片等，即可随时领离婚证；人民法院则要起诉书、协议书、结婚证、身份证或者户口簿即可。如果夫妻双方有一样资料或者证件不具备，民政局就不会给办理离婚登记。退一步来讲，只有到法院去离婚比较方便。
四、从夫妻双方的自愿性来看，有所不同。
民政局协议离婚所具备的离婚条件之一就是：夫妻双方必须完全同意，没有任何商量的余地。只要有任何一方不同意，则在民政局无法办理离婚登记。人民法院审理离婚案件，不要求夫妻双方必须同意。
五、从协议的履行方面来看，强制执行的效力不同。
民政局协议离婚所备案的离婚协议书虽然有效，但是不具有强制执行的效力，当一方不履行协议内容时，另一方必须向法院另行起诉解决，而协议书中所约定的内容，并不是百分之百得到法律的支持。一旦产生纠纷，仍需法院判决，具有很大的不确定性。说白了，民政局只管把夫妻关系解除，其他问题全部靠你们自己的诚信度来解决。
如果是通过人民法院达成的调解协议离婚，法院撤销离婚登记有法院下达的调解书，具有可强制执行的效力。任何一方不履行法院的调解协议，对方即可向法院申请强制执行，法院通过查封、冻结、甚至拘留罚款等强制措施使对方必须遵守协议，更有保障。
【本文关联的相关法律依据】
《中华人民共和国民法典》
第二百零九条 【不动产物权登记的效力】不动产物权的设立、变更、转让和消灭，经依法登记，发生效力;未经登记，不发生效力，但是法律另有规定的除外。
依法属于国家所有的自然资源，所有权可以不登记。
第一千一百二十一条 【继承开始的时间及死亡先后的推定】继承从被继承人死亡时开始。
相互有继承关系的数人在同一事件中死亡，难以确定死亡时间的，推定没有其他继承人的人先死亡。都有其他继承人，辈份不同的，推定长辈先死亡;辈份相同的，推定同时死亡，相互不发生继承。
第一千一百二十二条 【遗产的定义】遗产是自然人死亡时遗留的个人合法财产。
依照法律规定或者根据其性质不得继承的遗产，不得继承。
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