如果员工自动离职，公司不可以不发工资。劳动者上班提供劳动的，就享有获得相应劳动报酬的权利。其可以与用人单位协商办理相关离职手续并领取工资。若协商不成的，可以向当地劳动保障部门（一般为劳动监察大队）投诉；或向劳动争议仲裁委员会申请劳动仲裁。
《劳动法》第五十条 工资应当以货币形式按月支付给劳动者本人。不得克扣或者无故拖欠劳动者的工资。 《劳动合同法》第八十五条 用人单位有下列情形之一的，由劳动行政部门责令限期支付劳动报酬、加班费或者经济补偿；劳动报酬低于当地最低工资标准的，应当支付其差额部分；逾期不支付的，责令用人单位按应付金额百分之五十以上百分之一百以下的标准向劳动者加付赔偿金： （一）未按照劳动合同的约定或者国家规定及时足额支付劳动者劳动报酬的； （二）低于当地最低工资标准支付劳动者工资的； （三）安排加班不支付加班费的； （四）解除或者终止劳动合同，未依照本法规定向劳动者支付经济补偿的。
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