法院会驳回起诉。
法院审判庭会审查立案庭的立案案由是否恰当，是否需要变更。如果认为需要变更，在判决书里变更。案由的最终确定以生效判决所认定的法律关系为准，而当判决生效后，案由已经不重要了，因为诉讼案由错误法院判决的目的不是其原因。债权人依照规定向人民法院起诉时作出选择后，在一审开庭以前又变更诉讼请求的，人民法院应当准许。对方当事人提出管辖权异议，经审查异议成立的，人民法院应当驳回起诉。
案由错误驳回起诉后，还可以按照规定的程序来申请再审处理，根据相关规定当事人对已经发生法律效力的判决、裁定，认为有错误的，可以向上一级人民法院申请再审;当事人一方人数众多或者当事人双方为公民的案件，也可以向原审人民法院申请再审。
案由错误驳回起诉的情况在司法实践中是比较常见的，有关驳回起诉的决定，是需要严格基于实际的诉讼请求事项来进行认定和处理的。
【本文所涉及的法律依据】：：
《最高人民法院关于适用的解释新刑事诉讼法司法解释》
第二十二条
原受理案件的人民法院在收到上级人民法院改变管辖决定书、同意移送决定书或者指定其他人民法院管辖的决定书后，对公诉案件，应当书面通知同级人民检察院，并将案卷材料退回，同时书面通知当事人；对自诉案件，应当将案卷材料移送被指定管辖的人民法院，并书面通知当事人。
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