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A、蛋白质的氮元素主要存在于肽键中,A错误;
B、组成蛋白质的氨基酸共有20种,但并不是每种蛋白质均含有20种氨基酸,B错误;
C、组成蛋白质的氨基酸的种类、数目和排列顺序、及肽链空间结构决定了蛋白质的功能,C错误;
D、蛋白质变性只是空间结构发生改变,肽键并没有变化,双缩脲试剂与肽键结合产生紫色反应,D正确.
故选:D.